人類需要吃醣類、蛋白質、脂肪、維生素和礦物質五大營養素才能正常生長，而植物的生長也需要食物，只是植物較人類低等，其食物以礦物質為主。

植物體的組成元素部分是從空氣中，部分是從水中，部分是從礦物質中取得，不足的部分則必須以人為的方式供應，而此不足的部份就是大眾所知的「肥料」。

在城田魚菜共生健康農場的系統剛建立的時候, 我們遇到了所有魚菜同好都碰過的問題: 發泡煉石泡到水就會浮起來。 一旦虹吸管啟動了, 整個介質床就像走山一樣坍塌下去, 這對於植物根系的固定是極為不利的, 所以當時我們下了一個決定, 去建材行買了幾包三分石子倒在煉石上層, 用石子的高密度和重量把發泡煉石壓住。

鉀 Potassium，K

鉀肥缺乏的情形在魚菜共生系統裡相當常見，但由於鉀的缺乏症狀很容易跟缺鎂、缺鐵甚至是缺氮肥混淆，一般種植者不容易清楚辨識。

Phosphate　磷　 PO4-3

氮N、磷P、鉀K是大家所熟知的植物所需主要營養，從比例上來說大約是19:12:5

魚菜共生系統內的氮肥來源就是我們經常測量的硝酸鹽NO3，充足與否很容易從測試劑的反應當中辨別，但磷肥缺乏的狀況卻無法如此容易辨識，尤其是才剛入門從事家庭園藝或農耕的朋友。